Der Hauptunterschied zwischen Polyten- und Lampenbürstenchromosom besteht darin, dass das Polytenchromosom ein riesiges, sechsarmiges und gebändertes Chromosom ist, das in vielen Dipteronfliegenarten vorhanden ist, während das Lampenbürstenchromosom ein riesiges Chromosom ist, das in Eizellen von Wirbeltieren vorhanden ist, die das Aussehen einer Lampenbürste haben.
Ein Chromosom bezieht sich auf eine fadenartige Struktur, die aus dicht gepackten DNA-Molekülen und Histonproteinen besteht. Es hat auch eine typische Form und eine durchschnittliche Größe. In einigen tierischen Zellen sind jedoch extrem große Chromosomen vorhanden. Strukturell sind sie riesige Chromosomen. Unter diesen riesigen Chromosomen sind Polyten und Lampenbürstenchromosom zwei Beispiele.