Der Hauptunterschied zwischen Gen und Allel besteht darin, dass das Gen eine spezifische Nukleotidsequenz ist, die für ein spezifisches Protein kodiert, während das Allel eine Variante eines Gens ist, entweder die dominante oder die rezessive Variante.
Ein Gen ist die Grundeinheit der Vererbung. Insbesondere hat es eine genaue Nukleotidsequenz, die für ein bestimmtes Proteinmolekül kodiert, was ein bestimmtes Merkmal ergibt. Gene gehen von den Eltern auf die Nachkommen über. Daher wird die genetische Information, die für die Gesamtfunktion des Organismus erforderlich ist, in Form von Genen gespeichert. Außerdem hat ein Chromosom viele Gene. Daher hat ein bestimmtes Gen einen bestimmten Ort im Chromosom, den wir als Ort bezeichnen. Normalerweise hat ein Gen zwei alternative Formen, die Allele genannt werden. Mit einfachen Worten, Allele sind die Varianten der Gene, entweder die dominante Variante oder die rezessive Variante. Sie befinden sich auf der gleichen Höhe wie die Schwesterchromatiden des Chromosoms.