Der Hauptunterschied zwischen Viroid und Virusoid besteht darin, dass Viroid ein kleiner infektiöser Erreger ist, der nur aus einer einzelsträngigen RNA besteht, während Virusoid eine Art infektiöser zirkulärer einzelsträngiger RNA ist, für deren Infektion ein Helfervirus erforderlich ist.
Viroid und Virusoid sind zwei Arten von infektiösen Partikeln, die aus einzelsträngiger RNA bestehen. Sie unterscheiden sich von Viren, da sie keine Proteinhülle besitzen. Ähnlich wie Viren können sie sich jedoch nicht selbst replizieren. Daher benötigen sie eine Wirtszelle, um sich zu reproduzieren. Darüber hinaus sind Viroide und Virusoide die kleinsten subviralen Replikons.