Der Hauptunterschied zwischen Cytochrom und Phytochrom besteht darin, dass Cytochrom ein Elektronentransfer-Häm-Protein ist, das an der aeroben Atmung beteiligt ist. Inzwischen ist Phytochrom ein Photorezeptorprotein, das für rotes und fernrotes Licht des sichtbaren Spektrums empfindlich ist.
Lebende Organismen haben verschiedene Arten von Pigmenten. Einige sind lichtabsorbierende Pigmente, während andere Atmungspigmente sind. Cytochrom ist ein Metalloprotein, das als Elektronenträger bei der aeroben Atmung wirkt. Inzwischen ist Phytochrom ein Photorezeptor, der rotes und fernrotes Licht aus dem sichtbaren Spektrum absorbiert. Im Vergleich zu Cytochrom sind Phytochrome in vielen Aspekten der Pflanzenentwicklung wichtig.