Der Hauptunterschied zwischen Alloantikörper und Autoantikörper besteht darin, dass der Alloantikörper ein Antikörper ist, der gegen Alloantigene produziert wird, bei denen es sich um Fremdantigene handelt, die durch Transfusion oder Schwangerschaft eingeführt werden. Inzwischen ist der Autoantikörper ein Antikörper, der mit Selbstantigenen reagiert.
Antikörper entstehen durch eine Immunantwort. Sie können das Vorhandensein, die Art und die Intensität einer Immunantwort widerspiegeln. Das Immunsystem sollte in der Lage sein, Selbstantigene und Fremdantigene getrennt zu identifizieren. Es ist entscheidend für seine Funktion. B-Zellen des Immunsystems produzieren Antikörper gegen Antigene. Alloantikörper und Autoantikörper sind zwei Arten solcher Antikörper. Alloantikörper entstehen durch die Einführung von Alloantigenen in den Körper durch Transfusion oder Schwangerschaft. Im Gegensatz dazu sind Autoantikörper Antikörper, die mit Selbstantigenen reagieren. Die Reaktion von Autoantikörpern mit Selbstantigenen ist für Entzündungen, Schäden und Funktionsstörungen von Geweben und Organen verantwortlich, die zu Anzeichen und Symptomen von Autoimmunerkrankungen führen.