Der Hauptunterschied zwischen transientem und ausgeglichenem Polymorphismus basiert auf dem Verhalten der Allele. Ein vorübergehender Polymorphismus ist der fortschreitende Ersatz eines Allels eines Gens durch ein anderes Allel, während ein ausgeglichener Polymorphismus die Aufrechterhaltung beider zwei verschiedener Allele eines Gens über die Zeit ist
Genetischer Polymorphismus ist eine oder zwei oder mehrere Varianten einer bestimmten DNA. Transienter und ausgeglichener Polymorphismus sind zwei Arten von Polymorphismus, die aufgrund zweier alternierender Allele eines Gens auftreten. Beim vorübergehenden Polymorphismus wird aus den beiden alternativen Allelen eines bestimmten Ortes ein Allel nach und nach durch ein anderes ersetzt. Bei einem ausgeglichenen Polymorphismus sind die beiden Allele im Gleichgewicht miteinander. Beide Versionen des Gens bleiben in der Population erhalten.