Der Hauptunterschied zwischen 1D- und 2D-Gelelektrophorese sind die Eigenschaften, die für die Trennung von Proteinen bei der Gelelektrophorese verwendet werden. Die 1D-Gelelektrophorese trennt Proteine nur basierend auf dem Molekulargewicht, während die 2D-Gelelektrophorese Proteine basierend auf ihrem isoelektrischen Punkt und Molekulargewicht trennt.
Die Proteintrennung durch Gelelektrophorese ist eine wichtige Technik zur Charakterisierung von Proteinen. Proteine haben unterschiedliche Eigenschaften; Daher ist die Trennung im Vergleich zur DNA-Trennung durch Agarose-Gelelektrophorese komplexer.
