Der Hauptunterschied zwischen BLAST und FastA besteht darin, dass BLAST ein grundlegendes Ausrichtungswerkzeug ist, das auf der Website des Nationalen Zentrums für Biotechnologie-Informationen verfügbar ist, während FastA ein Werkzeug zur Suche nach Ähnlichkeiten ist, das auf der Website des European Bioinformatics Institute verfügbar ist.
BLAST und FastA sind zwei Software, die häufig verwendet wird, um biologische Sequenzen von DNA, Aminosäuren, Proteinen und Nukleotiden verschiedener Spezies zu vergleichen und nach Ähnlichkeiten zu suchen. Diese Algorithmen wurden unter Berücksichtigung der Geschwindigkeit geschrieben. Als Wissenschaftler Mitte der 1980er Jahre im Labor DNA isolieren konnten, bestand die Notwendigkeit, identische Gene für die weitere Forschung mit hoher Geschwindigkeit zu vergleichen und zu finden. Daher wurden diese beiden Softwareprogramme so entwickelt, dass Benutzer schnell nach ähnlichen Sequenzen mit denen ihrer Abfragesequenzen suchen können.
BLAST ist eine Abkürzung für Basic Local Alignment Search Tool und verwendet den lokalisierten Ansatz zum Vergleichen der beiden Sequenzen. FastA ist eine Software, die sich auf Fast A bezieht, wobei A für Alle steht. Hier arbeitet die Software mit Alphabeten wie Fast A für die DNA-Sequenzierung und Fast P für Protein. Sowohl BLAST als auch FastA vergleichen sehr schnell jede Genomdatenbank und sind daher sowohl finanziell als auch zeitsparend sehr rentabel.
