Der Hauptunterschied zwischen virulenten und gemäßigten Phagen besteht darin, dass virulente Phagen Bakterien während jedes Infektionszyklus abtöten, da sie sich nur über den Lysezyklus replizieren, während gemäßigte Phagen Bakterien nicht unmittelbar nach der Infektion abtöten, da sie sich sowohl mit lytischen als auch mit lysogenen Zyklen replizieren.
Phagen oder Bakteriophagen sind Viren, die Bakterien infizieren. Viren vermehren sich über zwei Mechanismen als Lysezyklus und Lysogenzyklus. Es gibt zwei Haupttypen von Phagen, die auf den Mechanismen der Infektion und Abtötung des Wirtsbakteriums beruhen: virulente Phagen und gemäßigte Phagen. Virulente Phagen replizieren über den Lysezyklus. Gemäßigte Phagen replizieren sowohl über lytische als auch über lysogene Zyklen. Virulente Phagen zeigen eine generalisierte Transduktion und können das Wirtsbakterium nach jedem Infektionszyklus abtöten. Gemäßigte Viren zeigen eine spezialisierte Transduktion und töten das Wirtsbakterium nicht unmittelbar nach der Infektion ab. Sie sind in der Lage, virale DNA in das Bakterienchromosom zu integrieren und bleiben für mehrere Bakteriengenerationen im Prophagenstadium, ohne das Bakterium abzutöten.