Der Hauptunterschied zwischen orthologen und paralogen Genen besteht darin, dass orthologe Gene die homologen Gene sind, die aufgrund der Speziation in verschiedenen Spezies gefunden werden, und sie erfüllen dieselbe Funktion. Im Gegensatz dazu sind paraloge Gene die Gene, die aufgrund von Duplikationen innerhalb einer einzelnen Spezies gefunden werden und unterschiedliche Funktionen haben können.
Homologie ist der Prozess der Abstammung von einem gemeinsamen Vorfahren. Daher stammen homologe Gene von gemeinsamen Ahnengenen. Orthologe und paraloge Gene sind zwei Arten von homologen Genen. Orthologe Gene kommen in verschiedenen Arten vor. Sie haben sich aufgrund von Speziation entwickelt und können eine ähnliche Funktion erfüllen. Im Gegensatz dazu finden sich paraloge Gene innerhalb einer einzelnen Spezies. Sie sind das Ergebnis genetischer Duplikationen und können unterschiedliche Funktionen haben.
