Der Hauptunterschied zwischen Biokohlenstoff und fossilem Kohlenstoff besteht darin, dass Biokohlenstoff eine Form von erneuerbarem Kohlenstoff ist, der in biologischen Systemen wie Pflanzen, Tieren, Mikroorganismen, Boden und Ozeanen vorkommt, während fossiler Kohlenstoff eine Form von nicht erneuerbarem Kohlenstoff in fossilen Brennstoffen ist.
Kohlenstoff ist ein Makroelement, das in allen lebenden Organismen und nicht lebenden Bestandteilen vorhanden ist. Kohlenstoff zirkuliert durch die Lithosphäre, Atmosphäre und Hydrosphäre, um das Gleichgewicht aufrechtzuerhalten. Daher liegt Kohlenstoff in verschiedenen Formen wie Gas, Feststoff und Flüssigkeit vor. Das Hauptkohlenstoffreservoir ist der atmosphärische Kohlenstoff in Form von Kohlendioxidgas. Der Austausch von Kohlenstoff hält ein natürliches Gleichgewicht aufrecht. Dieses Gleichgewicht wurde jedoch weitgehend durch menschliche Aktivitäten verzerrt. Biokohlenstoff und fossiler Kohlenstoff sind die beiden Hauptformen von Kohlenstoff.